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TruSeq Stranded mRNA文庫制備(48樣本)測序

簡要描述:TruSeq Stranded mRNA文庫制備(48樣本)測序
先前稱為TruSeq Stranded mRNA文庫制備試劑盒(目錄號RS-122-2101,RS-122-2102和RS-122-2103)的產物現稱為TruSeq Stranded mRNA。產品配置已更改。在新配置中,庫準備和索引適配器可以單獨購買。

  • 產品型號:20020594(ssv21106)
  • 廠商性質:生產廠家
  • 更新時間:2019-06-14
  • 訪  問  量:4555
詳細介紹
品牌illumina/美國因美納產地類別進口
應用領域醫療衛生,生物產業

產品名稱:TruSeq Stranded mRNA Library Prep (48 Samples)

附推廣RNA相關產品,如有需求,請在推文中查詢;更多產品,歡迎咨詢)

產品貨號:20020594(ssv21106)

產品規格:

分析時間            ~10.5小時

動手時間            ~4.5小時

輸入數量            0.1 - 1 ug總RNA或10 - 100 ng以前分離的mRNA(來自具有polyA尾的物種)

內容規格            用鏈信息捕獲編碼轉錄組

行動機制            Oligo-dT珠子捕獲polyA尾巴

復                  1-96

描述                通過精確的鏈信息為研究人員提供清晰,全面的編碼轉錄組視圖。

專業樣品類型        不兼容FFPE

物種詳情            使用來自任何具有polyA尾巴的物種的高質量RNA

系統兼容性          Genome Analyzer IIx,HiSeq 1000,HiSeq 1500,HiSeq 2000,HiSeq 2500,HiSeq 3000,HiSeq 4000,MiSeq,NextSeq 500,NextSeq 550,NovaSeq 6000

變體類              基因融合,新型轉錄本,單核苷酸多態性(SNPs),轉錄變體

物種類別            哺乳動物,大鼠,人類,牛,老鼠

核酸類型            RNA

技術                測序

方法                mRNA測序

線條特異性          擱淺

 

產品名稱:TruSeq Stranded mRNA文庫制備(48樣本)測序       產品貨號:20020594(ssv21106)

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產品介紹:TruSeq Stranded mRNA為編碼轉錄組分析提供了簡化,經濟高效且可擴展的解決方案。它與各種樣品兼容。

鋼絞線方向檢測

獲得mRNA鏈方向的精確測量,用于檢測反義轉錄,增強的轉錄物注釋和增加的比對效率。高覆蓋度均勻性增強了諸如替代轉錄物,基因融合和等位基因特異性表達等特征的發現。

成本效益

鏈狀信息識別來自給定RNA轉錄物的2條DNA鏈中的哪一條。該信息提供了對轉錄物注釋的增強的置信度,特別是對于非人類樣品。鑒定鏈來源增加了比對的讀數百分比,降低了每個樣品的測序成本。

可擴展

該工作流程可以對標準樣品和低質量樣品進行可靠的詢問,并且工作流程與各種研究設計兼容。

 

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文庫制備                              

品牌                  產品貨號          產品名稱

illumina品牌          20020594          TruSeq® Stranded mRNA Library Prep (48 Samples)文庫制備            

illumina品牌          20020595          TruSeq® Stranded mRNA Library Prep (96 Samples)文庫制備            

                                    

引物接頭                              

品牌                  產品貨號          產品名稱

illumina品牌          20020492          TruSeq® RNA Single Indexes Set A (12 Indexes, 48 Samples)引物接頭            

illumina品牌          20020493          TruSeq® RNA Single Indexes Set B (12 Indexes, 48 Samples)引物接頭            

illumina品牌          20019792          TruSeq RNA CD Index Plate (96 Indexes, 96 Samples)引物接頭            

illumina品牌          20020591          IDT for Illumina-TruSeq RNA UD Indexes (24 Indexes, 96 Samples)引物接頭            

illumina品牌          20022371          IDT for Illumina-TruSeq RNA UD Indexes (96 Indexes, 96 Samples)引物接頭            

 

配件產品                              

品牌                  產品貨號          產品名稱

illumina品牌          20024144          Illumina® Free Adapter Blocking Reagent (12 reactions)配件產品            

illumina品牌          20024145          Illumina® Free Adapter Blocking Reagent (48 reactions)配件產品      

 

文庫制備試劑盒                        

品牌                  產品貨號          產品名稱

illumina品牌          RS-122-2101        TruSeq Stranded mRNA Library Preparation Kit Set A (48 samples, 12 indexes)文庫制備試劑盒      

illumina品牌          RS-122-2102        TruSeq Stranded mRNA Library Preparation Kit Set B (48 samples, 12 indexes)文庫制備試劑盒      

illumina品牌          RS-122-2103        TruSeq Stranded mRNA Library Prep Kit High Throughput (96 samples, 96 indexes)文庫制備試劑盒    

 

Illumina二代測序技術,邊合成邊測序(SBS),是廣泛采用的新一代測序(NGS)技術,負責產生世界上90%以上的測序數據。

Illumina的二代測序技術稱為邊合成邊測序(Sequencing-by-Synthesis,簡稱SBS)。SBS主要包括堿基延伸、熒光激發及信號收集、剪切等3個步驟。這3個步驟可以重復,循環進行。每循環一次測定一個堿基。想測定多少個堿基(即讀長),就循環多少次。測序循環次數可以在軟件里設定。到底測序多長合適,要根據項目性質和需求來決定。大多數情況下,SR實驗(單端測序)測定1x50個堿基,PE實驗(雙端測序)測定2x150個堿基。

1 堿基延伸

Illumina測序試劑里所使用的dNTP特色,它們同時具有兩個修飾基團:一個熒光基團,一個可逆終止基團。A、G、C、T 4種堿基分別標記4種不同的熒光基團,它們在不同波長的激光激發下,能夠發射不同波長(即顏色)的熒光。熒光顏色與堿基種類一一對應,因此根據激發光的波長可以識別堿基。4種堿基的終止基團是一樣的。由于終止基團的存在,所有dNTP每次都只能延伸1個堿基,無論給予多長的反應時間。又由于該終止基團是可逆的,在熒光信號收集完畢之后,可以用剪切劑切除該終止基團,使堿基恢復自然的可延伸狀態,這時即可繼續進行下一輪循環,再測定一個堿基。

可逆終止基團技術是Illumina二代測序的一大特色。它與橋式PCR技術一起,構成了Illumina二代測序的兩大支柱,為穩定獲得高質量的測序數據打下了堅實的基礎。

2 信號采集

HiSeq系列測序儀具有紅綠兩根激光管,兩個濾色片。它們兩兩組合,可以形成4種不同的激發波長,正好分別用于激發A、G、C、T 4種堿基。

Cluster上所標記的熒光基團在激光激發下產生的信號,可以用相機拍攝或者掃描的方式收集信號。掃描技術速度比較快,被X10系列采用。由于FC面積比較大,而且上表面和下表面要分別拍照,所以拍照過程相當耗時。對于經典的HiSeq 2000來說,一次測序循環所產生的熒光信號,需要大約40分鐘的時間才能拍照收集完畢,時間比測序反應本身還要長。

3 剪切

熒光信號收集完畢后,關閉激光,用剪切劑去除測序引物的延伸產物上的堿基所標記的熒光基團和終止基團。兩個修飾基團均被切除,一方面消去干擾熒光,一方面使鏈末端的堿基回復到自然的可延伸狀態,為下一輪測序做好準備。

再重復合成、激發、收集等步驟,即可進行第二個堿基的測序。

測序循環可以重復多次。理論上可以一直重復,直到信噪比降低得無法有效識別堿基信號為止。由于熒光基團的發光效率持續不斷在衰減,Taq酶的活性也在持續不斷地衰減,所以實際上測序循環次數是有限的,大重復次數與sbs試劑的配方有關。測序的循環次數可以在軟件設置過程中人為,這個重復次數就是每個測序片段的讀長。目前,Illumina平臺的讀長有2x100 bp,2x125 bp,2x150 bp,2x300 bp等多種,其中2x150 bp用得較廣泛。

 

單端測序:單端測序(Single-read)首先將DNA樣本進行片段化處理形成200-500bp的片段,引物序列連接到DNA片段的一端,然后末端加上接頭,將片段固定在flow cell上生成DNA簇,上機測序單端讀取序列。

 

雙端測序:雙端測序(Paired-end)方法是指在構建待測DNA文庫時在兩端的接頭上都加上測序引物結合位點,在*輪測序完成后,去除*輪測序的模板鏈,用對讀測序模塊(Paired-End Module)引導互補鏈在原位置再生和擴增,以達到第二輪測序所用的模板量,進行第二輪互補鏈的合成測序。

 

基因測序是一種新型基因檢測技術,能夠從血液或唾液中分析測定基因全序列,預測罹患多種疾病的可能性,個體的行為特征及行為合理?;驕y序技術能鎖定個人病變基因,提前預防和治療。

基因測序相關產品和技術已由實驗室研究演變到臨床使用,可以說基因測序技術,是下一個改變世界的技術 。

基因測序只是基因檢測的方法之一,其又叫基因譜測序,是上*的一種基因檢測標準。

基因測序廣為人知的還有針對唐氏綜合征篩查的無創產前基因檢測。只需要采集孕婦的外周血,通過對血液中游離DNA(包括胎兒游離DNA)進行測序,并將測序結果進行生物學分析,從而得出胎兒是否患有染色體數目異常的疾病,包括常見的21-三體綜合征(唐氏綜合征)、18-三體綜合征(愛德華氏綜合征)和13-三體綜合征(Patau綜合征)。

 

附推廣:illumina品牌—RNA相關產品:

品牌                    產品貨號                產品名稱

illumina品牌        RS-200-1001        TruSeq RNA EPH Reagent Tube

illumina品牌        RS-303-1002        TruSight RNA Pan-Cancer Panel Set A

illumina品牌        RS-303-1003        TruSight RNA Pan-Cancer Panel Set B

illumina品牌        RS-304-1002        TruSight RNA Fusion Panel Set A (48 samples)

illumina品牌        RS-304-1003        TruSight RNA Fusion Panel Set B (48 samples)

illumina品牌        RT-101-1001        TruSeq Targeted RNA Custom Panel Kit (48 samples)

illumina品牌        RT-102-1001        TruSeq Targeted RNA Custom Panel Kit (96 samples)

illumina品牌        RT-201-1001        TruSeq Targeted RNA Neurodegeneration Panel Kit (48 samples)

illumina品牌        RT-201-1002        TruSeq Targeted RNA Hedgehog Panel Kit (48 samples)

illumina品牌        RT-201-1004        TruSeq Targeted RNA Wnt Panel Kit (48 samples)

illumina品牌        RT-201-1005        TruSeq Targeted RNA Stem Cell Panel Kit (48 samples)

illumina品牌        RT-201-1006        TruSeq Targeted RNA Cytochrome p450 Panel Kit (48 samples)

illumina品牌        RT-201-1007        TruSeq Targeted RNA p53 Panel Kit (48 samples)

illumina品牌        RT-201-1008        TruSeq Targeted RNA NFkB Panel Kit (48 samples)

illumina品牌        RT-201-1009        TruSeq Targeted RNA Cardiotoxicity Panel Kit (48 samples)

illumina品牌        RT-201-1010        TruSeq Targeted RNA Apoptosis Panel Kit (48 samples)

illumina品牌        RT-202-1001        TruSeq Targeted RNA Neurodegeneration Panel Kit (96 samples)

illumina品牌        RT-202-1002        TruSeq Targeted RNA Hedgehog Panel Kit (96 samples)

illumina品牌        RT-202-1004        TruSeq Targeted RNA Wnt Panel Kit (96 samples)

illumina品牌        RT-202-1005        TruSeq Targeted RNA Stem Cell Panel Kit (96 samples)

illumina品牌        RT-202-1006        TruSeq Targeted RNA Cytochrome p450 Panel Kit (96 samples)

illumina品牌        RT-202-1007        TruSeq Targeted RNA p53 Panel Kit (96 samples)

illumina品牌        RT-202-1008        TruSeq Targeted RNA NFkB Panel Kit (96 samples)

illumina品牌        RT-202-1009        TruSeq Targeted RNA Cardiotoxicity Panel Kit (96 samples)

illumina品牌        RT-202-1010        TruSeq Targeted RNA Apoptosis Panel Kit (96 samples)

illumina品牌        RT-801-1001        TruSeq Targeted RNA Supplemental Content Kit (48 samples)

illumina品牌        RT-802-1001        TruSeq Targeted RNA Supplemental Content Kit (96 samples)

illumina品牌        RZE1224            Ribo-Zero? rRNA Removal Regents (Epidemiology) 24 Reactions

illumina品牌        RZH110424          Ribo-Zero? rRNARemoval Kit (H/M/R) 24rxns

illumina品牌        RZHM11106          Ribo-ZeroTM Gold rRNA Removal Reagents (Human/Mouse/Rat)

illumina品牌        RZMB12324          Ribo-Zero? rRNA Removal Reagents (Bacteria) 24 Reactions

illumina品牌        RZNB1056          Ribo-Zero rRNA-Removal Reagents (Gram-Negative Bacteria) 6 Rxns

illumina品牌        RZPL11016          Ribo-Zero rRNA Removal Reagents (Plant Leaf) 6 Rxns

illumina品牌        RZSR11036          Ribo-Zero rRNA Removal Reagents (Plant Seed/Root) 6 Rxns

illumina品牌        T4RL2DML-X        T4 RNA Ligase 2, Deltion Mutant-Bulk

illumina品牌        T7R100UML-X        T7 RNA Polymerase (100 U/ul)-Bulk

illumina品牌        T7R1KUML-X        T7 RNA Polymerase-Bulk; 1,000 U/ul

illumina品牌        T7R50UML-X        T7 RNA Polymerase (50 U/ul) - Bulk

illumina品牌        TAB1R80524        TargetAmp 1-Round Biotin-aRNA Amplification Kit 105 24 Rxns

 

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